Misiunea Fundatiei Copii in Dificultate este de a asigura ingrijire si asistenta copiilor cu boli neurologice grave, celor cu dizabilitati, dar si copiilor cu risc crescut la abandon familial si scolar, proveniti din familii dezavantajate socio-economic. Totodata, fundatia promoveaza principiul egalitatii de sanse si incluziunea sociala a acestor categorii de copii.

Pentru copiii cu boli neurologice grave, Fundatia CID a infiintat in anul 1999 in Bucuresti un centru rezidential special amenajat si echipat care acorda gazduire, asistenta medicala si ingrijire personalizata, suport emotional, terapie, socializare pentru copii cu boli neurologice grave, avand o capacitate de 23 de locuri. In acest centru care este printre putinele din tara, in cei 19 ani de functionare au fost ingrijiti 150 de copii diagnosticati cu boli asociate grave, abandonati in spitale si care nu aveau nici o sansa de supravietuire fara o ingrijire adecvata.

Tot in Bucuresti, Fundatia CID a infiintat in anul 2000 primul centru de zi pentru copii cu tulburari din spectrul autist (TSA), in parteneriat cu o scoala speciala, asigurand astfel accesul la terapie specializata, recuperare si integrare scolara si comunitara unui numar de 485 de copii. De asemena parintii acestor copii au beneficiat de consiliere psihologica si de un program special de instruire “Scoala pentru parinti” care le-a permis sa inteleaga particularitatile de comportament ale copilului cu TSA si sa dobandeasca cunostintele si abilitatile necesare pentru a raspunde adecvar atat in familie cat si comunitate la comportamentul specifica al copilului.

Timp de 10 ani, Fundatia CID a desfasurat programe de recuperare si reintegrare socio-scolara pentru copiii cu dificultati de dezvoltare, in cadrul carora 856 de copii cu afectiuni motorii, ortopedice, genetice, cu tulburari de limbaj si vorbire, cu tulburari de comportament au beneficiat de servicii specializate de logopedie, terapie cognitiv-comportamentala, kinetoterapie si terapie ocupationala.

Incepand din anul 2009 Fundatia a dezvoltat parteneriate cu unitati scolare din Bucuresti si judetele Ilfov si Arges in vederea derularii de proiecte ce au avut ca obiective prevenirea abandonului scolar, imbunatatirea accesului si participarii la educatie ale elevilor din mediul rural, din familii dezavantajate socio-economic, din comunitatea roma si a celor cu dificultati de adaptare socio-scolara.

In cadrul acestor proiecte educationale 898 de elevi si 120 de prescolari au beneficiat de servicii de informare, orientare si consiliere scolara, consiliere psihologica pentru copil si familie, programe educationale prin activitati extracurriculare in scopul dobandirii de catre copii a competentelor cheie necesare mentinerii in educatie, participarii active la procesul educational si pregatirii acestora pentru integrarea pe piata muncii.  Prin serviciile de consiliere si informare oferite unui numar de 1200 de  parinti,  acestia si-au imbunatatit atitudinea fata de rolul si importanta educatiei scolare in viata copiilor lor si au dobandit capacitatile necesare implicarii active in sustinerea copiilor in cadrul procesului educational

O componenta importanta in cadrul acestor proiecte a constituit-o organizarea si sustinerea, de catre specialistii fundatiei care au si calificarea de formator, a unor seminarii de perfectionare pentru cadrele didactice in vederea dobandirii de competente si abilitati necesare dezvoltarii unor metode specifice educationale care sa asigure participarea la educatie a acestor categorii de elevi.